Juupajoen kunnan sivistystoimi tarjoaa mahdollisuuden peruskoulun suorittamiseen ihmisläheisessä ja yksilöt huomioivassa oppimisympäristössä.

Kunnassa toimii kaksi koulua, niin sanottuna pienten lasten kouluna toimiva Kirkonkylän koulu, josta löytyvät lukuvuonna 2019-2020 esiopetuksen lisäksi luokat 1-2 sekä Korkeakoskella sijaitseva Juupajoen koulukeskus, jossa puolestaan toimivat tänä lukuvuonna luokat 3-9.